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Author Archives: Tadashi Imanishi

2018年10月12日にパシフィコ横浜で開催されたBioJapan/MY-BYO Japanのステージにて、細菌叢の迅速なゲノム解析システムの実演デモを実施しました。しかし、今回は残念ながら失敗に終わりました...。DNAシークエンサーの消耗品パーツであるフローセルの状態が不良であったことが原因です。

期待して見に来てくださった方々には、申し訳ありませんでした。

今回のプレゼンで本システムに興味を持ってくださった方は、ぜひご連絡ください。

2018年9月19日から21日まで山形県鶴岡市で開催された第7回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2018)に参加し、2件の口頭発表を行いました。

プログラムはこちら

「個人ゲノム情報に基づくヒト顔形状の予測をめざして」
今西規1、中川草1、木村亮介2、瀧靖之3、安藤寿康4
(1. 東海大学医学部、2. 琉球大学大学院医学研究科、3. 東北大学加齢医学研究所、4. 慶應大学文学部)

「真核生物ゲノムに内在化したウイルス様配列データベースgEVEを活用したトランスクリプトーム解析」
中川草1、上田真保子2、Kirill Kryukov1、三橋里美3、三橋弘明4、今西規1
(1. 東海大学医学部 分子生命科学、2. 東海大学マイクロ・ナノ研究開発センター、3. 横浜市立大学大学院医学研究科 遺伝学、4. 東海大学工学部 生命化学科)

このうち「個人ゲノム情報に基づくヒト顔形状の予測をめざして」は、本大会の優秀口頭発表賞を受賞しました。関係者の皆様に深く感謝申し上げます。

certificate

細菌叢の迅速なゲノム解析システムの実演デモ

September 7th, 2018 | Posted by Tadashi Imanishi in Conference | Event - (0 Comments)

2018年10月10-12日にパシフィコ横浜で開催されるBioJapan 2018の中で、神奈川県が展示会「MY-BYO Japan 2018」を実施しますが、その中の東海大学ブースで当研究室が開発している細菌叢の迅速なゲノム解析システムを展示することになりました。さらに、下記の時間帯にはシステムの実演デモを行うことになりました。30分というごく短い時間の間にゲノムシーケンスを行い、細菌の組成を示すことに挑戦する予定です。ぜひお集まりください。

日時: 2018年10月12日(金)11:45-12:15
場所: パシフィコ横浜、BioJapan 2018内、MY-BYO Japan 2018のステージにて

BioJapan 2018
https://www.ics-expo.jp/biojapan/ja/

展示会「MY-BYO Japan 2018」
http://www.pref.kanagawa.jp/docs/mv4/me-byo-summit/summit/2017/exhibition.html

日本経済新聞の電子版で紹介されました

August 26th, 2018 | Posted by Tadashi Imanishi in News - (0 Comments)

日本経済新聞の電子版でわれわれの研究が紹介されました。
「手のひらサイズの遺伝子解読機、感染症の現場に」というタイトルの記事です。
2018年8月21日の日経産業新聞にも掲載されました。

記事はこちらでご覧いただけます。

医学部の専門選択科目として「医学情報解析のための計算機プログラミング」を開催しました。
この科目は予想を上回る人気で、定員2名のはずが4名も参加してくれました。
5日間の実習を行い、全員がパソコンやクラウド上で機械学習のプログラムを動かすことに成功しました。
とても優秀な学生さん達でした。

東海大学医学部では、2018年度より研究課題「迅速ゲノム解析と人工知能を用いた感染症診断支援システムの開発」(2018-2020年度、代表:今西規)を実施します。これは、次世代シーケンサ等を利用して感染症のゲノム診断技術を開発することをめざす研究です。本研究において主にウェットの実験部分を担当する研究技術員(修士以上)を募集します。ゲノム科学研究の経験者を歓迎しますが、DNA解析の基本を習得された方ならば、次世代シーケンサは未経験でも可です。「ゲノム情報を生かした未来の医療を創る」という研究室のモットーに賛同し、チャレンジ精神にあふれた方のご応募をお待ちしています。

[業務内容]
次世代シーケンサ等を用いたゲノム解析研究(主にウェット解析を担当する)
[勤務地]
東海大学医学部基礎医学系分子生命科学(神奈川県伊勢原市下糟屋143)
[募集人員] 1名
[着任時期] 2018年11月1日以降、応相談
[雇用期間] 2019年3月末まで(次年度に延長の可能性あり)
[給与] 東海大学の規定による(研究技術員は時給制)。交通費支給。
[勤務時間] 原則的には月-金で1日7時間ですが、相談に応じます。
[休日] 土・日・祝日
[保険] 社会保険加入
[応募方法] 履歴書、研究業績リスト、抱負(200字程度)を郵送またはメール送付。
推薦状を添付することも可です。
[締切] 2018年10月25日(木)。適任者がみつかった場合は早期に終了します。
[選考内容・方法] 書類選考の後、面接を行います。テレビ会議面接も可。
[送付先・問い合わせ先]
〒259-1193神奈川県伊勢原市下糟屋143
東海大学医学部基礎医学系分子生命科学
今西 規 宛
E-mail: bmi-sec [[at]] ml.u-tokai.ac.jp
電話: 0463-93-1121内線2143
[詳細] 研究室HP(http://bmi.med.u-tokai.ac.jp/)およびJREC-IN: D118090304

学部学生向けの見学会を実施します

July 10th, 2018 | Posted by Tadashi Imanishi in Event | News - (0 Comments)

学部学生向けに、当研究室の見学会を実施します。東海大学の学部生の卒業研究や大学院の進学先として当研究室を候補に考えている方は、ぜひこの機会にご来室ください。
まずは研究室のスタッフが研究内容を説明し、その後で実験室の見学、さらには卒研生やポスドクとの面談が可能です。
7月中の平日の午前中または夕方の時間帯に、予約制で実施します。お誘い合わせの上、下記へご連絡ください。

予約の連絡先: bmi-sec@ml.u-tokai.ac.jp
当日の場合はお電話で、0463-93-1121内線2143まで。

場所は伊勢原キャンパス1号館、7階、7G04室です。地図はこちらです。

学部学生の受け入れ

April 15th, 2018 | Posted by Tadashi Imanishi in News - (0 Comments)

当研究室では、基礎医学研究に興味のある学生を広く受け入れています。
東海大学医学部の学部2年生、3年生、4年生の場合は、選択科目「医学情報解析のための計算機プログラミング」(夏季集中開講)を履修することで、単位を取得することも可能です。その他の学年でも自由に参加ができます。他学部、他大学でもご相談に応じます。
ゲノム情報解析をしてみたい、DNAシークエンサーを使ってみたい、計算機の技術を身につけたい、医学の進歩のために何かやってみたい、研究の現場を自分の目で見てみたい、など動機は何でも結構です。
いつでもご連絡ください。

 

新人歓迎会を開催

April 13th, 2018 | Posted by Tadashi Imanishi in Event - (0 Comments)

新たにメンバーに加わった2名の歓迎会を、いつものイタリアンレストランで開催しました。新人の活躍を期待しています。

情報生物医学研究室の新体制

April 2nd, 2018 | Posted by Tadashi Imanishi in News - (0 Comments)

2018年4月から情報生物医学研究室のメンバー構成が変わります。
まず、横浜市立大学木原生物学研究所の研究員であった松前ひろみさんが特任助教として加入しました。
また、先月から東海大学工学部生命化学科4年の須藤恵美さんが卒研生として加入しています。
このほか、中川草さんは講師へ昇進しました。
新しいメンバーを迎え、新体制で心機一転、研究に取り組んでまいります。