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Author Archives: Tadashi Imanishi

送別会を開催しました

March 30th, 2018 | Posted by Tadashi Imanishi in Event - (0 Comments)

4月から健康学部へ移る柴田講師と、3月で卒業する卒研生の浅見さんの送別会を開催しました。
OBや家族も参加して、賑やかな会となりました。

party

日本細菌学会(福岡)での研究発表

March 30th, 2018 | Posted by Tadashi Imanishi in Conference | Event | News - (0 Comments)

2018年3月27-29日に福岡国際会議場で開催された第91回日本細菌学会総会および第14回日韓国際微生物学シンポジウムに参加し、研究発表を行いました。今回は、Classifying metagenomic reads using GenomeSync and Genome Search Toolkit(著者:Kryukov K and Imanishi T)というタイトルでのポスター発表です。これは、メタゲノム解析のために有用なゲノム配列データベースと解析ソフトウエアの紹介です。

ところで、細菌学会でもOxford Nanopore Technology社(ONT社)によるナノポア・シークエンサーが非常に注目されていました。当研究室が昨年論文発表した迅速なメタゲノム解析システム(こちらを参照)もONT社のシークエンサーを使用していますが、今でも多くの問い合わせをいただいています。迅速に細菌叢の解析を行いたいが、計算機による配列データ解析でお困りの方はとても多いようです。当研究室ではこうした方々を技術面で支援いたしますので、どうぞお問い合わせください。

これまで2年半にわたり、日本医療研究開発機構(AMED)感染症研究国際展開戦略プログラム(J-GRID)の研究課題「迅速・正確な感染症診断を可能にする病原微生物同定システムの開発」を実施してきましたが、今月いっぱいで終了になります。そこで、これまでの研究成果を公開するための報告会を開催します。どなたでも参加できますので、どうぞお集まりください。

日時: 2018年3月16日(金)14:00-18:00
場所: 東海大学伊勢原キャンパス・松前記念講堂2
地図はこちら–> Google Map

プログラム: こちらからダウンロードしてください。–>プログラム

なお、報告会の終了後には懇親会(会費制)を開催予定です。懇親会に参加ご希望の方は事前にメールでお知らせください。
メール送付先: bmi-sec@ml.u-tokai.ac.jp

実験医学 2018年1月号

December 12th, 2017 | Posted by Tadashi Imanishi in Event | Paper - (0 Comments)

実験医学2018年1月号は「ナノポア」DNAシークエンサーの特集です。
われわれの研究室からも2本の論文を寄稿していますので、ぜひご覧ください。

https://www.yodosha.co.jp/jikkenigaku/book/9784758125031/

新しいメンバーが加入しました

November 5th, 2017 | Posted by Tadashi Imanishi in Event | News - (0 Comments)

日本学術振興会特別研究員の坂口翔一研究員(写真の後部、中央)が10月から新たに当研究室に参加することになり、近隣のレストランで歓迎会を開きました。久しぶりに全員の集合写真が撮れました。

理化学研究所と共同で、Scientific Reports誌に論文を発表しました。

Ogawa T, Kryukov K, Imanishi T, and Shiroguchi K (2017) The efficacy and further functional advantages of random-base molecular barcodes for absolute and digital quantification of nucleic acid molecules. Scientific Reports 7: 13576.

論文
https://www.nature.com/articles/s41598-017-13529-3
プレスリリース(理研)
http://www.riken.jp/pr/press/2017/20171019_2/
プレスリリース(JST)
http://www.jst.go.jp/pr/announce/20171019-4/index.html

Springer Natureのホームページに日本語要旨が掲載

October 5th, 2017 | Posted by Tadashi Imanishi in News | Paper - (0 Comments)

今年7月にScientific Reports誌に発表した論文”A portable system for rapid bacterial composition analysis using a nanopore-based sequencer and laptop computer” (Scientific Reports 7:5657)について、Springer Natureが運営するホームページから「おすすめコンテンツ」として日本語要旨を掲載していただきました。下記アドレスです。

http://www.natureasia.com/ja-jp/srep/abstracts/89257

また、Scientific Reports日本語メールマガジンにも掲載されるそうです。

情報生物医学研究室開設5周年

October 2nd, 2017 | Posted by Tadashi Imanishi in Event | News - (0 Comments)

情報生物医学研究室(今西研究室)が東海大学医学部に開設されて、ちょうど5年が経過しました。思えば5年前は全くのゼロからスタートしましたが、今では何とか研究成果を出し続けることができる体制が作れたと思います。今後ともどうぞよろしくお願い申し上げます。

中川助教が日本進化学会研究奨励賞を受賞

August 28th, 2017 | Posted by Tadashi Imanishi in Conference | News - (0 Comments)

2017年8月24日から26日にかけて京都大学で開催された日本進化学会第19回大会で、中川草助教が日本進化学会研究奨励賞を受賞しました。
こちらは授賞式の模様です。

共同研究の成果を論文発表しました

August 16th, 2017 | Posted by Tadashi Imanishi in Paper - (0 Comments)

共同研究の成果をThe Journal of Experimental Medicine誌に論文発表しました。詳細は「研究業績」のページからリンクをたどってください。

Tenno M, Shiroguchi K, Muroi S, Kawakami E, Koseki K, Kryukov K, Imanishi T, Ginhoux F, and Taniuchi I (2017) Cbfβ2-deficiency preserves Langerhans cell precursors by lack of selective TGFβ receptor signaling. The Journal of Experimental Medicine (in press).