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Author Archives: Tadashi Imanishi

疾患関連ゲノム多型のデータベースVaDEについて論文発表しました

November 7th, 2014 | Posted by Tadashi Imanishi in Database | Paper - (Comments Off on 疾患関連ゲノム多型のデータベースVaDEについて論文発表しました)

「再現性」に着目した疾患関連ゲノム多型のデータベースVaDEについて、論文をNucleic Acids Research誌に発表しました。オンラインでご覧いただけます。

Nagai Y†, Takahashi Y†, and Imanishi T* (2014) VaDE: a manually-curated database of reproducible associations between various traits and human genomic polymorphisms. Nucleic Acids Research, Database Issue 2014;doi:10.1093/nar/gku1037.

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個人ゲノム解析コンテストで最優秀賞を受賞

October 7th, 2014 | Posted by Tadashi Imanishi in Conference | News - (Comments Off on 個人ゲノム解析コンテストで最優秀賞を受賞)

2014年10月4日に仙台で開催された第三回生命医薬情報学連合大会の公開セッションでは、匿名個人のゲノム配列を使ってその個人が誰なのかを当てるという前代未聞の企画が実施されました。当研究室はこのコンテストに参加し、出生地や身体的特徴などのプロファイリング結果を発表しました。個人の特定には至らなかったものの、最優秀賞をいただくことができました。詳細は日経バイオテクONLINEの記事にも紹介されています(有料)。

第三回生命医薬情報学連合大会公開セッション https://biomedpharminfo.org/open_session/

日経バイオテクONLINE記事 第一報(有料) https://bio.nikkeibp.co.jp/article/news/20141006/179406/

日経バイオテクONLINE記事 第二報(有料) https://bio.nikkeibp.co.jp/article/news/20141009/179461/

 

宮田満氏から賞品を受け取る今西教授 賞品の萩の月
宮田満氏から賞品を受け取る今西教授(左)、賞品の萩の月(右)

Kirill Kryukov研究員が最優秀発表賞を受賞

October 7th, 2014 | Posted by Tadashi Imanishi in Conference | News - (Comments Off on Kirill Kryukov研究員が最優秀発表賞を受賞)

2014年10月2-4日に仙台で開催された第三回生命医薬情報学連合大会で、本研究室のKirill Kryukov研究員は”Homology Search Management Tool”というタイトルでゲノム配列の相同性検索を支援するツールの開発について発表し、連合大会最優秀発表賞(IIBMP2014 Best Presentation Award)を受賞しました。同時に、Kryukov研究員は参加者が投票で選ぶ参加者セレクト賞(Community-Selected Excellent Poster Award)も受賞しました。

連合大会ホームページの受賞者一覧 https://biomedpharminfo.org/awards/

授賞式でのKryukov研究員(右) 賞状 賞品の萩の月
授賞式でのKryukov研究員(左)、賞状(中央)、賞品の萩の月(右)

東海大学医学部1年生の体験学習「ヒトゲノム情報解析入門」

September 6th, 2014 | Posted by Tadashi Imanishi in News - (Comments Off on 東海大学医学部1年生の体験学習「ヒトゲノム情報解析入門」)

医学部1年生の学生4名が5日間にわたり当研究室に参加し、基礎研究の現場を体験しました。計算機を使って個人のゲノム情報の解析を行ったり、論文紹介セミナーに参加するなど、盛りだくさんの内容でした。

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VaDEデータベースの新versionを公開しました

August 25th, 2014 | Posted by Tadashi Imanishi in Database - (Comments Off on VaDEデータベースの新versionを公開しました)

遺伝的形質のゲノム情報データベース VarySysDB Disease Edition (VaDE)を更新し、version 1.3としました。

  • 関連の再現性の評価法をより厳密にし、独立な研究によって支持される疾患関連ゲノム多型の情報を提供。
  • 2型糖尿病に関連するゲノム多型の情報をマニュアルキュレーションによって追加。
  • 解説文の追記。

データベースのURLは http://bmi-tokai.jp/VaDE/ です。

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