当研究室におけるデータベース・ソフトウエアの研究開発業務に携わるシステムエンジニアを募集します。
業務内容
Linux上で稼働している既存のWebアプリケーションを改良するための
ソースコード調査、プログラム開発、ドキュメント作成の作業を行う。
必要なスキル
JavaによるWebアプリケーション開発（strutsの経験があればなお可）
期間：2015年2月2日（月）から3月31日（火）
勤務日：週5日（月ー金）
休日：土曜、日曜、祝日
勤務時間：9:00-17:00（勤務7時間、休憩1時間）、残業あり、詳細は応相談
勤務地：東海大学伊勢原キャンパス（小田急線伊勢原駅から20分）
時給：（規定により決定）
締切：2015年1月9日（金）（早く終了することがあります）（終了しました）
ご応募、ご質問等は今西までお願いします（imanishi@tokai-u.jp）。
Our new paper about VaDE database was published in Nucleic Acids Research.
Nagai Y†, Takahashi Y†, and Imanishi T* (2014) VaDE: a manually-curated database of reproducible associations between various traits and human genomic polymorphisms. Nucleic Acids Research, Database Issue 2014;43(Database issue):D868-72. doi: 10.1093/nar/gku1037.
「再現性」に着目した疾患関連ゲノム多型のデータベースVaDEについて、論文をNucleic Acids Research誌に発表しました。オンラインでご覧いただけます。
Nagai Y†, Takahashi Y†, and Imanishi T* (2014) VaDE: a manually-curated database of reproducible associations between various traits and human genomic polymorphisms. Nucleic Acids Research, Database Issue 2014;doi:10.1093/nar/gku1037.
2014年10月4日に仙台で開催された第三回生命医薬情報学連合大会の公開セッションでは、匿名個人のゲノム配列を使ってその個人が誰なのかを当てるという前代未聞の企画が実施されました。当研究室はこのコンテストに参加し、出生地や身体的特徴などのプロファイリング結果を発表しました。個人の特定には至らなかったものの、最優秀賞をいただくことができました。詳細は日経バイオテクONLINEの記事にも紹介されています（有料）。
第三回生命医薬情報学連合大会公開セッション https://biomedpharminfo.org/open_session/
日経バイオテクONLINE記事 第一報（有料） https://bio.nikkeibp.co.jp/article/news/20141006/179406/
日経バイオテクONLINE記事 第二報（有料） https://bio.nikkeibp.co.jp/article/news/20141009/179461/
宮田満氏から賞品を受け取る今西教授（左）、賞品の萩の月（右）
2014年10月2-4日に仙台で開催された第三回生命医薬情報学連合大会で、本研究室のKirill Kryukov研究員は”Homology Search Management Tool”というタイトルでゲノム配列の相同性検索を支援するツールの開発について発表し、連合大会最優秀発表賞（IIBMP2014 Best Presentation Award）を受賞しました。同時に、Kryukov研究員は参加者が投票で選ぶ参加者セレクト賞（Community-Selected Excellent Poster Award）も受賞しました。
連合大会ホームページの受賞者一覧 https://biomedpharminfo.org/awards/
授賞式でのKryukov研究員（左）、賞状（中央）、賞品の萩の月（右）
10/2〜4に仙台で開催されている生命医薬情報学連合大会 2014に今西、中川、Kryukov、高橋が参加しています。
今西は初日のオミックス医療学会のワークショップにて、中川は二日目のJSBiハイライトトラック1にて口頭発表します。Kryukovと高橋はポスターにて研究発表予定です。
そして最終日のセッションではKryukovと今西が取り組んでいた匿名の被験者Xのゲノム解析の結果を発表します。
Four students of Tokai University School of Medicine visited our laboratory for a week to experience basic research activities. They joined the journal club, and analyzed personal genome sequences using computers.
医学部１年生の学生４名が５日間にわたり当研究室に参加し、基礎研究の現場を体験しました。計算機を使って個人のゲノム情報の解析を行ったり、論文紹介セミナーに参加するなど、盛りだくさんの内容でした。
A new version of VaDE database was released.
遺伝的形質のゲノム情報データベース VarySysDB Disease Edition (VaDE)を更新し、version 1.3としました。
データベースのURLは http://bmi-tokai.jp/VaDE/ です。
